Preview

Математические заметки СВФУ

Расширенный поиск

ГОМОКЛИНИЧЕСКИЕ ЦИКЛЫ В ОДНОЙ МОДЕЛИ ГЕННОЙ СЕТИ

Аннотация

Гомоклинические циклы, образованные гетероклиническими траекториями и стационарными точками, существуют в основном в динамических системах с симметрией и могут подвергаться различным бифуркациям. В статье изучаются глобальные аспекты модели генных сетей с тремя переменными и численно исследуется бифуркация гомоклинического цикла, состоящего из трех седел и трех гетероклинических орбит. Представляет большой интерес тот факт, что бифуркация гомоклинического цикла характеризуется высокой параметрической чувствительностью к начальным данным. В этом случае при небольших возмущениях концентраций мы сталкиваемся со случайным переходом от релаксационных коле баний, соответствующих наблюдаемому устойчивому предельному циклу, близкому к треугольному гомоклиническому циклу, к различным устойчивым стационарным состояниям. Сценарий разрушения треугольного гомоклинического цикла имеет простой биологический смысл: в окрестности бифуркационных значений параметров в то время, когда происходит генерация релаксационных импульсов в генной сети, малые флуктуационные выбросы концентраций могут «сбивать» систему с колебательного режима и случайным образом стабилизировать ее к существенно различным стокам.

Об авторах

Г. А. Чумаков
Институт математики им. С. Л. Соболева СО РАН; Новосибирский гос. университет
Россия

Чумаков Геннадий Александрович

Институт математики им. С. Л. Соболева СО РАН,
пр. Академика Коптюга, 4, Новосибирск 630090;

Новосибирский гос. университет,
ул. Пирогова, 2, Новосибирск 630090



Н. А. Чумакова
Институт катализа им. Г. К. Борескова СО РАН; Новосибирский гос. университет
Россия

Чумакова Наталия Алексеевна

Институт катализа им. Г. К. Борескова СО РАН,
пр. Акад. Лаврентьева 5, Новосибирск 630090;

Новосибирский гос. университет,
ул. Пирогова, 2, Новосибирск 630090



Список литературы

1. Колчанов Н. А. Регуляция транскрипции генов эукариот: базы данных и компьютерный

2. анализ//Молекулярная биология.1997 .№31.С.581–583.

3. Колчанов Н. А., Игнатьева Е. В., Подколодная О. А., Лихошвай В. А.,Матушкин Ю. Г.

4. Генные сети//Вавилов. журн. генетики и селекции. 2013. Т. 17, №4/2.С.833–850.

5. Golubyatnikov V., Likhoshvai V., Ratushny A. Oscillatory gene networks and Hopf bifurca

6. tion//7thInt.Conf.HumanandComputer–2004.2004.P.72–77.

7. Волокитин Е. П. Определьных циклах в простейшей модели гипотетической генной

8. сети//Сиб.журн.индустр.математики.2004.Т.7,№3.С.58–65.

9. XiaoM.,CaoJ.GeneticoscillationsdeducedfromHopfbifurcationinageneticregulatory

10. networkwithdelays//Math.Biosci..2008.V.215,N1.P.55–63.

11. КастлерГ.Возникновениебиологическойорганизации.М.:Мир,1967.

12. ГукенхаймерДж.,ХолмсФ.Нелинейныеколебания,динамическиесистемыибифурка

13. циивекторныхполей.М.;Ижевск:Ин-ткомпьютер.исслед.,2002.106

14. Golubyatnikov V. P., Likhoshvai V. A., Fadeev S. I., Matushkin Yu. G., Ratushny A. V.,

15. Kolchanov N. A. Mathematical and computer modeling of genetic networks // 6th Int. Conf.

16. Human and Computer–2003. University of Aizu, Japan. 2003. P. 200–205.

17. Kuznetsov Yu. A. Elements of applied bifurcation theory. New York: Springer-Verl., 2004.

18. Чумаков Г. А., Лашина Е. А., Чумакова Н. А. Максимальные семейства периодических

19. решений кинетической модели гетерогенной каталитической реакции // Вестн. Новосиб.

20. гос. ун-та. Сер. Математика, механика, информатика. 2005. Т. V, № 4. С. 3–20.

21. Chumakova N. A., Chumakova L. G., Kiseleva A. V., Chumakov G. A. Computation of

22. periodic orbits in a three-dimensional kinetic model of catalytic hydrogen oxidation // Sel¸cuk

23. J. Appl. Math.. 2002. V. 3, N 1. P. 3–20. (http://www5.in.tum.de/selcuk/sjam).

24. Chumakov G. A., Lashina E. A., Chumakova N. A. On estimation of the global error of

25. numerical solution on canard-cycles // Math. Comput. Simul. 2014. http://dx.doi.org/10.1016/

26. j.matcom.2014. 10.003 (in press).

27. Баутин Н. Н., Шильников Л. П. Поведение динамических систем вблизи границ области

28. устойчивости состояний равновесия и периодических движений («опасные» и «безопас

29. ные» границы) // Бифуркация рождения цикла и ее приложения. Дополнение I.. М.:

30. Мир, 1980. С. 294–316.


Рецензия

Для цитирования:


Чумаков Г.А., Чумакова Н.А. ГОМОКЛИНИЧЕСКИЕ ЦИКЛЫ В ОДНОЙ МОДЕЛИ ГЕННОЙ СЕТИ. Математические заметки СВФУ. 2014;21(4):97-106.

For citation:


Chumakov G.A., Chumakov N.A. HOMOCLINIC CYCLES IN A GENE NETWORK MODEL. Mathematical notes of NEFU. 2014;21(4):97-106. (In Russ.)

Просмотров: 16

JATS XML


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2411-9326 (Print)
ISSN 2587-876X (Online)